Klips yöntemi ile sünnet işlemi pipinin bölgesel olarak uyuşturulması ile başlar böylece sünnet sırasında ağrı önlenmiş olur. Glans denilen pipinin baş kısmının bittiği yer, sünnet derisinin nereden kesileceğini gösterir. Kesilecek sünnet derisi, sünnet öncesinde belirlendiği için az ya da fazla kesme gibi bir risk durumu bulunmaz. Çocuğun sünnet sırasında hareketli olması sabit durmaması vb durumlar sonucu etkilemez.
Pipi ucu çevresindeki deri sıyrılıp tamamen temizlenip mikroptan arındırıldıktan sonra klips yerleştirilir.
Daha sonra sünnet derisi bu klipsin üzerine çekilir ve iç bölgeye yerleştirilen plastik kısım pipi başını koruyarak kesim işlemi sırasında pipide bir hasar oluşmasını önler. Sünnet sonrası çocuğunuz rahatlıkla yerleştirilen tüpün içinden idrarını yapabilir.
İç plastik yerleştirildikten sonra, bu bölümün dışında kalan sünnet derisinin etrafına diğer plastik parça yerleştirilir. İkinci plastik parçanın alt ucu, önceden belirlenmiş olan kesilecek sünnet derisi sınırına getirilir. Klipsin tüm parçalarını yerleştirdiğimizde, sünnet derisi iç ve dış plastiklerin arasında kalır ve daha sonra kilitlenerek klips sabitlenir. Böylece sünnet derisi iki plastik arasında sıkıştırılmış olur.
Sünnet derisinin etrafına yerleştirilen klips deriyi sıkıştırırken pipiye basınç uygulamaz. Klips takıldıktan sonra sadece sünnet derisindeki kan akımını kesmiş oluruz yani pipinin kan akımı etkilenmez. Klips kilitlendikten sonra kendiliğinden açılamaz sadece plastik çember kesilerek çıkartılabilir. Daha sonra iç ve dış plastikler arasında sıkışmış ve artık kan akımı kesilmiş olan sünnet derisi, dış plastiğin belirlenen sınırından itibaren cerrahi bistüriyle kesilerek çıkartılır. Lazer, elektrokoter vb kullanılmadığından penis sinirlerine ve damarlarına zarar verme ihtimali yoktur ve ileride sünnete bağlı cinsel işlev sorunları görülmesi bir durum söz konusu olmaz.
Sünnet işlemi ortalama 5 dakika sürer, işlemde kullanılan cerrahi bistüriler, klipsler vb tek kullanımlık olup steril paketlerde bulunur ve enfeksiyon riski bulunmaz. Sünnet derisi kesildikten sonra işlem bitmiş olur ve bebek/çocuk kısa bir süre istirahat ettikten sonra kıyafetlerini giyip çıkabilir. Klips çocuğun yaşına göre 3-5 gün içinde sünneti uygulayan sağlık uzmanları tarafından çıkartılır, kendiliğinden veya elle çekerek çıkartılamaz.